Τα εργαστήρια δεν έχουν τακτικό χαρακτήρα και αποτελούν παράλληλες δράσεις, είτε της Επίσκεψης του Μουσείου, είτε του Ελεύθερου Παιχνιδιού με σκοπό την παραπέρα ενασχόληση και εμβάθυνση των παιδιών. Μια παρουσίαση της συλλογής που δίνει έμφαση στο παιχνίδι-κούκλα, μπορεί να συνδυάζεται με ένα εργαστήριο κατασκευής κούκλας, και το πέταγμα του χαρταετού ως παιχνίδι με ένα εργαστήριο κατασκευής χαρταετού. Τα εργαστήρια είναι περισσότερο απαιτητικά στην προετοιμασία και την οργάνωσή τους και υποστηρίζονται από εξειδικευμένο ανθρώπινο δυναμικό π.χ. καλλιτέχνες. Τα παιδιά ανακαλύπτουν τις δεξιότητες και τα ταλέντα τους και αντλούν ικανοποίηση από τις δημιουργίες τους.
